Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms