Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hace1Q3U0D9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms