Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hbq1bQ3U0A6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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Hbq1bQ3U0A6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hbq1bQ3U0A6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hbq1bQ3U0A6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Hbq1bQ3U0A6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hbq1bQ3U0A6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hbq1bQ3U0A6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Hbq1bQ3U0A6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Hbq1bQ3U0A6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Hbq1bQ3U0A6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hbq1bQ3U0A6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Hbq1bQ3U0A6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hbq1bQ3U0A6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hbq1bQ3U0A6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hbq1bQ3U0A6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hbq1bQ3U0A6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hbq1bQ3U0A6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hbq1bQ3U0A6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Hbq1bQ3U0A6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hbq1bQ3U0A6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Hbq1bQ3U0A6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hbq1bQ3U0A6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hbq1bQ3U0A6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Hbq1bQ3U0A6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hbq1bQ3U0A6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hbq1bQ3U0A6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hbq1bQ3U0A6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Hbq1bQ3U0A6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Hbq1bQ3U0A6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Hbq1bQ3U0A6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Hbq1bQ3U0A6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Hbq1bQ3U0A6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Hbq1bQ3U0A6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Hbq1bQ3U0A6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hbq1bQ3U0A6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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