Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Psmd1Q3TXS7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd1Q3TXS7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms