Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms