Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms