Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR2

Xlr4c, X-linked lymphocyte-regulated 4C, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4cQ3TKR2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms