Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd8Q3TA59 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms