Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms