Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Treml4Q3LRV9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Treml4Q3LRV9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Treml4Q3LRV9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Treml4Q3LRV9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Treml4Q3LRV9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Treml4Q3LRV9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Treml4Q3LRV9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Treml4Q3LRV9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Treml4Q3LRV9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Treml4Q3LRV9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Treml4Q3LRV9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Treml4Q3LRV9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms