Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne9Q1RLL3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms