Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms