Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo3bQ1EG27 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myo3bQ1EG27 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms