Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms