Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q149G0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q149G0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q149G0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q149G0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q149G0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q149G0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q149G0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q149G0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q149G0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q149G0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q149G0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q149G0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q149G0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q149G0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q149G0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q149G0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q149G0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q149G0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q149G0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q149G0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q149G0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q149G0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q149G0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q149G0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q149G0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q149G0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q149G0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q149G0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q149G0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q149G0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q149G0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q149G0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q149G0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q149G0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q149G0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q149G0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q149G0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q149G0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q149G0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q149G0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q149G0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q149G0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q149G0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q149G0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q149G0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q149G0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q149G0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q149G0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q149G0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q149G0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q149G0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q149G0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q149G0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q149G0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q149G0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q149G0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q149G0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q149G0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q149G0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q149G0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q149G0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q149G0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q149G0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q149G0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q149G0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q149G0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q149G0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q149G0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q149G0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q149G0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q149G0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q149G0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q149G0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q149G0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q149G0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q149G0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q149G0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms