Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms