Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms