Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne7Q0VE82 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne7Q0VE82 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms