Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rundc1Q0VDN7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rundc1Q0VDN7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms