Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Cntnap5cQ0V8T7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Cntnap5cQ0V8T7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Cntnap5cQ0V8T7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cntnap5cQ0V8T7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms