Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrriq1Q0P5X1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrriq1Q0P5X1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrriq1Q0P5X1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrriq1Q0P5X1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrriq1Q0P5X1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrriq1Q0P5X1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrriq1Q0P5X1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrriq1Q0P5X1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms