Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r181Q0P547 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r181Q0P547 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms