Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms