Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kndc1Q0KK55 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms