Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NeblQ0II04 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms