Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CbfbQ08024 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms