Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MestQ07646 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MestQ07646 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MestQ07646 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MestQ07646 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MestQ07646 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MestQ07646 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MestQ07646 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MestQ07646 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MestQ07646 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MestQ07646 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MestQ07646 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MestQ07646 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MestQ07646 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MestQ07646 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MestQ07646 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MestQ07646 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MestQ07646 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MestQ07646 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MestQ07646 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MestQ07646 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MestQ07646 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MestQ07646 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MestQ07646 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MestQ07646 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MestQ07646 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MestQ07646 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MestQ07646 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MestQ07646 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MestQ07646 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MestQ07646 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MestQ07646 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MestQ07646 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MestQ07646 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MestQ07646 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MestQ07646 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MestQ07646 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MestQ07646 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MestQ07646 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MestQ07646 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MestQ07646 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MestQ07646 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MestQ07646 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MestQ07646 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MestQ07646 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MestQ07646 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MestQ07646 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MestQ07646 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MestQ07646 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MestQ07646 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MestQ07646 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MestQ07646 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MestQ07646 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MestQ07646 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MestQ07646 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MestQ07646 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MestQ07646 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MestQ07646 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MestQ07646 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MestQ07646 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MestQ07646 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MestQ07646 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MestQ07646 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MestQ07646 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MestQ07646 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MestQ07646 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MestQ07646 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MestQ07646 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MestQ07646 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MestQ07646 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MestQ07646 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MestQ07646 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MestQ07646 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MestQ07646 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MestQ07646 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MestQ07646 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MestQ07646 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MestQ07646 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MestQ07646 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MestQ07646 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MestQ07646 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MestQ07646 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MestQ07646 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MestQ07646 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MestQ07646 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MestQ07646 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MestQ07646 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MestQ07646 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MestQ07646 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MestQ07646 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MestQ07646 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MestQ07646 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MestQ07646 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MestQ07646 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MestQ07646 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MestQ07646 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MestQ07646 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MestQ07646 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MestQ07646 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MestQ07646 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms