Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Col17a1Q07563 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col17a1Q07563 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms