Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmbpQ07456 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms