Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah1bQ06985 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms