Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CluQ06890 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CluQ06890 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CluQ06890 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CluQ06890 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CluQ06890 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CluQ06890 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CluQ06890 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CluQ06890 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CluQ06890 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CluQ06890 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CluQ06890 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CluQ06890 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CluQ06890 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CluQ06890 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CluQ06890 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CluQ06890 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CluQ06890 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CluQ06890 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CluQ06890 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CluQ06890 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CluQ06890 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CluQ06890 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CluQ06890 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CluQ06890 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CluQ06890 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CluQ06890 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CluQ06890 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CluQ06890 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CluQ06890 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CluQ06890 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CluQ06890 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CluQ06890 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CluQ06890 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CluQ06890 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CluQ06890 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CluQ06890 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms