Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms