Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fmn1Q05860 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms