Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms