Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms