Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms