Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smarcad1Q04692 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms