Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Cxcr5Q04683 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcr5Q04683 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms