Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms