Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms