Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms