Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Muc1Q02496 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Muc1Q02496 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Muc1Q02496 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Muc1Q02496 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Muc1Q02496 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Muc1Q02496 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Muc1Q02496 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Muc1Q02496 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms