Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms