Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VcpQ01853 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms