Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1cQ01815 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms