Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme2Q01768 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nme2Q01768 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nme2Q01768 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nme2Q01768 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nme2Q01768 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nme2Q01768 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nme2Q01768 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms