Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mc1rQ01727 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms