Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EgfrQ01279 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms