Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col1a2Q01149 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms