Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Grin2bQ01097 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Grin2bQ01097 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Grin2bQ01097 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Grin2bQ01097 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Grin2bQ01097 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Grin2bQ01097 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Grin2bQ01097 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Grin2bQ01097 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Grin2bQ01097 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Grin2bQ01097 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Grin2bQ01097 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Grin2bQ01097 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Grin2bQ01097 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Grin2bQ01097 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Grin2bQ01097 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms